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ProteinTools : a toolkit to analyze protein structures

DOI zum Zitieren der Version auf EPub Bayreuth: https://doi.org/10.15495/EPub_UBT_00006493
URN zum Zitieren der Version auf EPub Bayreuth: urn:nbn:de:bvb:703-epub-6493-4

Titelangaben

Ferruz, Noelia ; Schmidt, Steffen ; Höcker, Birte:
ProteinTools : a toolkit to analyze protein structures.
In: Nucleic Acids Research. Bd. 49 (2021) Heft W1 . - W559-W566.
ISSN 1362-4962
DOI der Verlagsversion: https://doi.org/10.1093/nar/gkab375

Volltext

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Format: PDF
Name: gkab375.pdf
Version: Veröffentlichte Version
Verfügbar mit der Lizenz Creative Commons BY 4.0: Namensnennung
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Angaben zu Projekten

Projekttitel:
Offizieller Projekttitel
Projekt-ID
Protein Lego
647548

Projektfinanzierung: ERC Consolidator grant

Abstract

The experimental characterization and computational prediction of protein structures has become increasingly rapid and precise. However, the analysis of protein structures often requires researchers to use several software packages or web servers, which complicates matters. To provide long-established structural analyses in a modern, easy-to-use interface, we implemented ProteinTools, a web server toolkit for protein structure analysis. ProteinTools gathers four applications so far, namely the identification of hydrophobic clusters, hydrogen bond networks, salt bridges, and contact maps. In all cases, the input data is a PDB identifier or an uploaded structure, whereas the output is an interactive dynamic web interface. Thanks to the modular nature of ProteinTools, the addition of new applications will become an easy task. Given the current need to have these tools in a single, fast, and interpretable interface, we believe that ProteinTools will become an essential toolkit for the wider protein research community. The web server is available at https://proteintools.uni-bayreuth.de.

Weitere Angaben

Publikationsform: Artikel in einer Zeitschrift
Themengebiete aus DDC: 500 Naturwissenschaften und Mathematik > 540 Chemie
Institutionen der Universität: Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Chemie > Lehrstuhl Biochemie > Lehrstuhl Biochemie III - Proteindesign - Univ.-Prof. Dr. Birte Höcker
Fakultäten
Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften
Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Chemie
Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Chemie > Lehrstuhl Biochemie
Sprache: Englisch
Titel an der UBT entstanden: Ja
URN: urn:nbn:de:bvb:703-epub-6493-4
Eingestellt am: 12 Jul 2022 09:21
Letzte Änderung: 12 Jul 2022 09:21
URI: https://epub.uni-bayreuth.de/id/eprint/6493

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